Проект представили члены научно-редакционного совета издания:
Преосвященный Герасим (Шевцов), архиепископ Владикавказский и Аланский;
Игумен Иоанн (Рубин), ответственный секретарь издания, заместитель председателя Синодального отдела религиозного образования и катехизации Русской Православной Церкви;
Ирина Владимировна Кузьмина, ответственный редактор издания, старший преподаватель кафедры истории и гуманитарных дисциплин Николо-Угрешской духовной семинарии;
Дмитрий Иванович Петровский, ответственный секретарь Патриаршей комиссии по вопросам физической культуры и спорта.
«Собрание трудов равноапостольного Николая Японского» – церковно-научный проект Николо-Угрешской духовной семинарии по изучению и изданию наследия, выдающегося архипастыря Русской Православной Церкви, учёного востоковеда, дипломата, этнографа, лингвиста и переводчика, просветителя Японии, небесного покровителя Николо-Угрешской духовной семинарии – святителя Николая Японского.
Собрание трудов равноапостольного Николая Японского включает официальную переписку, частную переписку, речи, проповеди, научные труды, статьи и другие документы, многие из которых публикуются впервые. В состав издания также входят дневники равноапостольного Николая, карты миссионерских путешествий и сопутствующие материалы, относящиеся к деятельности Российской духовной миссии в Японии.